Mardini, Intan and Pane, Elfira Rosa and Wijayanti, Fitria (2022) DESAIN PRIMER GEN Cytocrhome Oxidase I (COI) SECARA IN SILICO UNTUK MENGIDENTIFIKASI DAGING BABI (Sus sp.). Undergraduate Thesis thesis, UIN Raden Fatah Palembang.
|
Text
Cover Skripsi.pdf Download (18kB) | Preview |
|
|
Text
Abstrak.pdf Download (269kB) | Preview |
|
![[img]](http://repository.radenfatah.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text
BAB 1.pdf Restricted to Registered users only Download (390kB) | Request a copy |
|
|
Text
Bab 2.pdf Restricted to Registered users only Download (814kB) | Request a copy |
|
|
Text
Bab 3.pdf Restricted to Registered users only Download (189kB) | Request a copy |
|
|
Text
Bab 4.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) | Request a copy |
|
|
Text
Bab 5.pdf Restricted to Registered users only Download (8kB) | Request a copy |
|
|
Text
Daftar Pustaka Skripsi.pdf Download (522kB) | Preview |
Abstract
DESAIN PRIMER GEN Cytocrhome Oxidase I (COI) SECARA IN SILICO UNTUK MENGIDENTIFIKASI DAGING BABI (Sus sp.) ABSTRAK Kasus pencampuran dan pemalsuan daging sapi maupun produk olahan daging dengan daging babi (Sus sp.) sangat meresahkan penduduk muslim di Indonesia. Salah satu metode yang dapat mendeteksi spesies dalam daging maupun produk olahan adalah metode PCR (Polymerase Chain Reaction) yang menggunakan primer sebagai salah satu komponen utama untuk mencapai keberhasilan dalam prosesnya. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain sepasang primer (Forward dan Reverse) terbaik yang dapat digunakan pada proses PCR untuk mengidentifikasi daging Sus sp. dan menampilkan visualisasi struktur protein pengkode gen COI serta mengetahui perbedaan asam amino penyusunnya. Desain primer dilakukan secara in silico yakni dengan bantuan program komputer, serta menggunakan DNA cetakan dari gen COI Sus sp. yang diunduh dari GenBank NCBI dengan kode akses AF304203.1. Berdasarkan hasil penelitian, diperoleh 13 pasang primer terbaik pada posisi dan amplikon yang bervariasi yaitu, primer forward pada posisi ke 364-381 (F1), 633-650 (F2), 362-379 (F3), 134-151 (F4), dan 627-644 (F5) dan primer reverse pada posisi ke 1050-1067 (R2), 1021-1038 (R4), 1157-1174 (R3), 1148-1165 (R5). Hasil visualisasi protein sus sp. dan sapi terdapat 16 posisi urutan asam amino yang berbeda yaitu, pada posisi ke 3, 8, 57, 189, 339, 407, 408, 415, 449, 469, 483, 484, 486, 489, 496 dan 511.
| Item Type: | Thesis (Undergraduate Thesis) |
|---|---|
| Uncontrolled Keywords: | Primer, Sus sp., Cytochrome Oxidase I (COI), visualisasi protein |
| Subjects: | Sains dan Teknologi > Biologi Sains dan Teknologi > Kimia |
| Divisions: | Fakultas Sains dan Teknologi > 47201 - Kimia |
| Depositing User: | INTAN MARDINI 1830802026 |
| Date Deposited: | 17 Feb 2023 04:05 |
| Last Modified: | 17 Feb 2023 04:05 |
| URI: | http://repository.radenfatah.ac.id/id/eprint/25407 |
Actions (login required)
 |
View Item |